내일은 제 생일입니다. (12월 6일)
내일 생일/생신을 맞이하시는 모든 분과 저 자신에게 생일(생신) 축하 드립니다.
제가 내일 일을 나가 글을 아침에 못 올릴것 같아 미리 올립니다.
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제가 조금 인내심을 가지고 기다려, 이 오미크론 변이 바이러스에 관한 전문 과학자분들의 분석 결과에 따른 실질적 영향에 관한 정보를 올렸어야 한다고 생각합니다.
다음은 학문의 여러분야에서, 특히 과학과 기술에서 세계 최고 권위의 저널 중 하나인
‘자연(nature)’에 실린 내용입니다.
세계에서 이 분야에 전문가이신 분들께서 하신 이 오미크론과 현상황에 대한 언급이십니다.
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https://www.nature.com/articles/d41586-021-03614-z
nature
소식
2021년 12월 2일
오미크론은 얼마나 나쁜가? 과학자들이 지금까지 알고 있는 것
코비드 연구원들은 변종의 전염성, 심각성 및 백신 회피 능력에 대해 알아보기 위해 엄청난 속도로 노력하고 있습니다.
남아프리카 공화국은 오미크론이라는 새로운 심하게 돌연변이된 변종으로 인해 코비드 사례가 크게 증가하고 있습니다.
보츠와나와 남아프리카의 과학자들이 현재 오미크론으로 알려진 빠르게 확산되는 사스코비드 2(SARS-CoV-2) 변종에 대해 세계에 경고한 지 겨우 일주일이 지났습니다. 전 세계의 연구원들은 현재 20개 이상의 국가에서 확인된 이 변종이 전 세계에 미치는 위협을 이해하기 위해 노력하고 있습니다. 그러나 과학자들이 오미크론에 대한 더 완전한 그림을 그리고 그 전염성과 심각성, 백신을 회피하고 재감염을 일으킬 수 있는 가능성을 이해하는 데 몇 주가 걸릴 수 있습니다.
분자 미생물학자이자 방글라데시 다카에 있는 아동 건강 연구 재단의 이사인 센주티 사하(Senjuti Saha)는 “내가 어디를 가든지 모두가 오미크론에 대해 더 자세히 알려달라”고 말합니다. "무슨 일이 일어나고 있는지에 대한 이해가 거의 없으며, 이는 과학자들에게도 사실입니다."
자연은(nature) 과학자들이 오미크론 변종에 대해 지금까지 알고 있는 것을 정리합니다.
오미크론은 얼마나 빨리 퍼지나요?
남아프리카에서 오미크론의 급속한 성장은 연구원들을 가장 걱정시키는 것입니다. 그 변종은 다른 곳에서 코비드 19(COVID-19) 사례의 폭발적인 증가를 촉발할 수 있기 때문입니다.
12월 1일, 남아프리카 공화국은 8,561건을 기록했는데, 이는 11월 26일의 3,402건, 11월 중순의 하루 수백 건에서 증가한 수치로, 요하네스버그의 고향인 가우텡 주에서 많은 증가가 발생했습니다.
역학자들은 각 감염에 의해 생성된 새로운 사례의 평균 수인 R을 사용하여 전염병의 성장을 측정합니다. 11월 말, 요하네스버그에 있는 남아프리카 국립전염병연구소(NICD)는가우텡 (Gauteng)에서 R이 2 이상임을 결정했습니다. 남아프리카 공화국 더반에 있는 콰줄루나탈 대학의 전염병 전문의인 리차드 레셀즈(Richard Lessels)는 지난주 언론 브리핑에서 이러한 성장 수준이 팬데믹 초기에 마지막으로 관찰되었다고 말했습니다.
카톨릭 대학의 진화 생물학자인 탐 웬셀리어스(Tom Wenseleers)는가우텡( Gauteng)의 R 값은 델타(Delta)가 우세한 변종이었고 사례가 감소하고 있던 9월에 1보다 훨씬 낮았으며, 이는 오미크론(Omicron)이 델타( Delta)보다 훨씬 더 빠르게 확산되고 훨씬 더 많은 사람을 감염시킬 가능성이 있음을 시사한다고 말했습니다. 탐 웬셀리어스(Tom Wenseleers)는 코비드 19 사례의 증가와 시퀀싱 데이터를 기반으로 같은 기간 동안 오미크론이 델타보다 3~6배 많은 사람들을 감염시킬 수 있다고 추정합니다. "그것은 바이러스에 큰 이점이지만 우리에게는 그렇지 않습니다."라고 그는 덧붙입니다.
스위스 베른 대학의 전산 역학자인 크리스티안 알트하우스(Christian Althaus)는 연구원들이 오미크론이 남아프리카의 다른 지역과 전 세계적으로 어떻게 퍼지는지 지켜보고 있다고 말했습니다. 남아프리카 공화국에서 감시가 강화되면 연구원들이 오미크론의 빠른 성장을 과대평가할 수 있습니다. 그러나 이러한 패턴이 다른 국가에서 반복된다면 오미크론이 전송 이점이 있다는 매우 강력한 증거가 될 것이라고 알트하우스(Althaus)는 덧붙입니다. "예를 들어 유럽 국가에서 발생하지 않는다면 상황이 좀 더 복잡해지고 면역학적 환경에 크게 의존한다는 의미입니다. 그래서 우리는 기다려야 합니다.”
오미크론 사례를 확인하려면 게놈 시퀀싱이 필요하지만 일부 *PCR 테스트는 델타와 구별되는 변이의 특징을 포착할 수 있습니다. 이 신호를 기반으로 영국에서 사례가 극히 적지만 사례가 증가하고 있다는 예비 징후가 있습니다. 알트하우스는 "그것은 확실히 우리가 지금 보고 싶은 것이 아니며 오미크론이 실제로 영국에서도 전송 이점을 가질 수 있음을 시사합니다."라고 덧붙였습니다.
(* 코비드 19 피씨알, COVID-19 PCR: polymerase chain reaction ) 검사란 무엇입니까?
코로나19에 대한 중합효소연쇄반응(PCR) 검사는 코로나19를 유발하는 바이러스인 사스 코비드2( SARS-CoV-2)의 유전물질(리보핵산 또는 RNA)을 찾아 상기도 검체를 분석하는 분자적 검사다. 과학자들은 PCR 기술을 사용하여 표본에서 소량의 리보핵산을( RNA) 디옥시리보핵산(DNA)으로 증폭합니다. 이 DNA는사스 코비드2( SARS-CoV-2)가 존재하는 경우 감지할 수 있을 때까지 복제됩니다. PCR 검사는 2020년 2월에 승인된 이후 코비드 19진단을 위한 황금 표준 검사였습니다. 정확하고 신뢰할 수 있습니다.)
오미크론은 백신이나 감염에 대한 면역을 극복할 수 있을까?
남아프리카에서 이 변종의 급격한 증가는 면역을 회피할 수 있는 능력이 있음을 암시합니다. 웬셀리어스(Wenseleers)는 남아프리카 공화국의 약 1/4이 완전히 예방 접종을 받았고 인구의 많은 부분이 이전 유행에서 사스 코비드 2(SARS-CoV-2)에 감염되었을 가능성이 있다고 밝혔습니다.
이러한 맥락에서 남부 아프리카에서 오미크론의 성공은 주로 예방 접종을 받은 사람들뿐만 아니라 델타 및 기타 변종으로 인한 코비드 19에서 회복된 사람들을 감염시킬 수 있는 능력 때문일 수 있습니다. 12월 2일 국립전염병 연구소의 연구원이 발표한 사전 인쇄1에 따르면 오미크론이 확산되면서 남아프리카 공화국에서 재감염이 증가했다고 합니다. "안타깝게도 이곳은 면역 탈출 변이체가 발달하기에 완벽한 환경입니다."라고 알트하우스는 말합니다.
영국 옥스퍼드 대학에서 바이러스 진화를 연구하는 아리스 카주라키스(Aris Katzourakis)는 변이체가 다른 곳으로 얼마나 잘 퍼지는지는 백신 접종 및 이전 감염률과 같은 요인에 달려 있다고 말했습니다. "다른 통제 조치를 포기한 백신 접종률이 높은 인구 집단에 그것을 던지면 거기에서 우위를 점할 수 있습니다."
연구원들은 면역 반응과 그들이 제공하는 보호를 회피하는 오미크론의 능력을 측정하기를 원합니다. 예를 들어, 요하네스버그에 있는 위트워터스랜드(Witwatersrand )대학과 국립전염병 연구소(NICD: National Institute of Communicable Disease)의 바이러스학자인 페니 무어(Penny Moore)가 이끄는 팀은 이전 감염과 백신 접종으로 촉발된 항체를 중화하거나 바이러스를 차단하여 오미크론이 세포를 감염시키는 것을 막는 능력을 측정하고 있습니다. 이를 실험실에서 테스트하기 위해 그녀의 팀은 사스 코비드2(SARS-CoV-2)의 스파이크 단백질을 사용하여 세포를 감염시키는 인체 면역 결핍 바이러스 (HIV: human immunodeficiency virus)의 조작된 버전인 '슈도바이러스' 입자를 만들고 있습니다. – 사스코비드2( SARS-CoV-2)의 스파이크 단백질을 사용하여 세포를 감염시키는 인체 면역 결핍 바이러스 (HIV: human immunodeficiency virus)의 조작된 버전 - 스파이크에 대한 최대 32개의 변화를 보유하는 오미크론과 일치합니다.
더반에 있는 아프리카 보건 연구소의 바이러스학자 알렉스 시갈이 이끄는 또 다른 남아프리카 팀은 전염성 사스 코비드2(SARS-CoV-2 )입자를 사용하여 바이러스 중화 항체에 대한 유사한 테스트를 수행하고 있습니다. 화이자-바이오엔텍(Pfizer-BioNTech) 백신 제조사와 협력해 오미크론에 대항하는 방법을 결정하고 있는 텍사스 대학 의과대학 갤버스턴 의과대학 바이러스학자 시페이용이 이끄는 팀도 마찬가지다. "스파이크에서 돌연변이의 별자리를 보았을 때 나는 정말로 매우 걱정했습니다."라고 그는 말합니다. "결과를 기다리기만 하면 됩니다."
특히 인간 세포의 수용체를 인식하는 영역에서 오미크론의 스파이크 돌연변이에 대한 이전 연구에서는 이 변이체가 항체를 중화시키는 능력을 약화시킬 것이라고 제안했습니다. 예를 들어, 2021년 9월 네이처(Nature) 논문2에서 뉴욕시 록펠러 대학의 바이러스학자인 폴 비에니아즈(Paul Bieniasz)가 공동으로 이끄는 팀은 오미크론과 함께 많은 돌연변이를 일으킨 코비드 19를(COVID-19) 일으킬 수 없는 바이러스에서 스파이크의 고도로 돌연변이된 버전을 설계했습니다. '다형 돌연변이 스파이크'는 그들이 테스트한 대부분의 사람들, 즉 2회분의 엠알엔에이(mRNA)백신을 맞았거나 코비드 19(COVID-19)에서 회복된 사람들의 중화 항체에 완전히 내성이 있는 것으로 판명되었습니다. 비에니아즈(Bieniasz)는 오미크론을 통해 "상당한 타격이 있을 것으로 예상합니다."라고 말합니다.
백신은 오미크론에 대해 어떤가요?
오미크론이 중화 항체를 피할 수 있다고 해서 백신 접종과 이전 감염에 의해 유발된 면역 반응이 변이체에 대한 보호를 제공하지 않는다는 의미는 아닙니다. 면역 연구에 따르면 적당한 수준의 중화 항체가 심각한 형태의 코비드 19( COVID-19)로부터 사람들을 보호할 수 있다고 호주 시드니에 있는 뉴사우스웨일스 대학의 면역학자인 마일즈 데번포트(Miles Davenport)가 말했습니다.
면역계의 다른 측면, 특히 T 세포는 항체 반응보다 오미크론 돌연변이의 영향을 덜 받을 수 있습니다. 남아프리카 공화국의 연구원들은 T 세포와 자연 살해 세포라고 불리는 또 다른 면역 인자의 활동을 측정할 계획이라고 위트워터스랜드(Witwatersrand ) 대학의 백신학자인 샤비프 마디(Shabir Madhi)는 말합니다.
남아공에서 코로나19 백신 실험을 주도한 마디는 오미크론에 대한 백신의 효과에 대한 역학 연구를 수행하려는 노력의 일환이기도 하다. 남아프리카에서 투여된 세 가지 백신(존슨앤존슨, 화이자, 아스트라제니카:Johnson & Johnson, Pfizer-BioNTech 및 Oxford-AstraZeneca)과 관련된 돌발 감염에 대한 일화 보고가 있습니다. 그러나 마디(Madhi)는 연구자들이 백신과 이전 감염에 의해 제공되는 오미크론에 대한 보호 수준을 정량화하기를 원할 것이라고 말합니다.
그는 그 결과가 아스트라제니카-옥스포드(AstraZeneca-Oxford ) 백신이 2020년 후반 남아프리카에서 확인된 면역 회피 변이인 베타 변이체에 대해 수행한 방식을 연상시킬 것이라고 생각합니다. 마디(Madhi)가 주도한 시험에서는 백신이 경증에 대한 보호를 거의 제공하지 않는 것으로 나타났습니다. 캐나다의 실제 분석에서는 입원에 대한 보호가 80% 이상인 것으로 나타났습니다.
오미크론이 유사하게 행동한다면 마디(Madhi)는 "우리는 사례가 급증하는 것을 보게 될 것입니다. 우리는 많은 획기적인 감염과 많은 재감염을 보게 될 것입니다. 하지만 입원율에 비해 지역사회의 발병률이 이렇게 쪼그라드는 일이 있을 것”이라고 말했다. 초기 보고서에 따르면 오미크론에 의한 대부분의 획기적인 감염은 경미했다고 마디( Madhi)는 말합니다. "저에게는 긍정적인 신호입니다."
현재의 부스터가 오미크론에 대한 보호 기능을 향상시킬 수 있을까요?
오미크론의 위협은 영국과 같은 일부 부유한 국가에서 코비드 백신 부스터 용량의 출시를 가속화하고 확대하도록 촉발했습니다. 그러나 이러한 용량이 이 변종에 대해 얼마나 효과적인지는 아직 명확하지 않습니다.
세 번째 용량은 중화 항체 수준을 과급하고 이것이 이러한 항체를 회피하는 오미크론의 능력에 대한 방어벽을 제공할 가능성이 있다고 비에니아즈(Bieniasz)는 말합니다. 그의 팀은 돌연변이 스파이크에 대한 연구에서 잽을 받기 몇 달 전에 코비드 19(COVID-19)에서 회복된 사람들이 돌연변이 스파이크를 차단할 수 있는 항체를 가지고 있음을 발견했습니다. 비에니아즈(Bieniasz)에게 이러한 결과는 감염 또는 추가 용량을 통해 사스 코비드2(SARS-CoV-2)의 스파이크 단백질에 반복적으로 노출된 사람들이 "오미크론에 대한 중화 활성을 가질 가능성이 상당히 높음"을 시사합니다.
오미크론은 이전 변종보다 더 경미하거나 아니면 더 심각한 질병을 유발합니까?
초기 보고서는 오미크론을 경증의 질병과 연관시켰고, 이 변이체가 이전의 일부보다 덜 심각할 수 있다는 희망을 불러일으켰습니다. 그러나 종종 일화나 부족한 데이터 스크랩을 기반으로 하는 이러한 보고서는 오해의 소지가 있을 수 있다고 영국 세인트앤드루스 대학의 전염병 전문가인 무게 세비크(Müge Çevik)는 경고합니다. "모두가 우리를 안내할 수 있는 데이터를 찾으려고 노력하고 있습니다."라고 그녀는 말합니다. "하지만 지금은 매우 어렵습니다."
변이의 심각성을 평가할 때의 주요 과제는 특히 발병이 지리적으로 국한된 경우 질병의 경과에 영향을 미칠 수 있는 많은 교란 변수를 제어하는 방법입니다. 예를 들어, 남아프리카 공화국의 오미크론 감염으로 인한 경미한 질병에 대한 보고는 그 국가가 이미 사스 코비드2(SARS-CoV-2)에 노출된 인구가 상대적으로 젊다는 사실을 반영할 수 있습니다.
델타 발병 초기에 이 변종은 다른 변종보다 어린이들에게 더 심각한 질병을 유발한다는 보고가 있었습니다. 세비크(Çevik) 는 더 많은 데이터가 수집되면 그 연관성이 해소된다고 말했습니다.
연구원들은 다른 국가의 오미크론 감염에 대한 데이터를 찾을 것입니다. 이러한 지리적 확산과 사례가 발생함에 따라 더 큰 표본 크기는 연구자들이 경증 질병의 초기 보고가 얼마나 일반화될 수 있는지에 대한 더 나은 아이디어를 제공할 것입니다. 궁극적으로 연구자들은 연령, 예방 접종 상태 및 건강 상태와 같은 중요한 요소 측면에서 두 그룹의 참가자가 일치하는 사례 통제 연구를 수행하기를 원할 것입니다. 입원 건수는 지역의 전체 병원 수용력에 영향을 받을 수 있으므로 두 그룹의 데이터를 동시에 수집해야 합니다.
그리고 결정적으로 연구자들은 경제적 궁핍의 수준을 통제해야 합니다. 빠르게 확산되는 새로운 변종은 직업이나 생활 조건의 특성에 따라 취약한 그룹에 더 빨리 도달할 수 있다고 세비크(Çevik)는 말합니다. 그리고 그러한 그룹은 종종 더 심각한 질병을 경험합니다.
이 모든 작업에는 시간이 걸립니다. "심각도 문제는 우리가 풀 수 있는 마지막 문제 중 하나가 될 것이라고 생각합니다."라고 그녀는 말합니다. "델타에서 그렇게 되었어요."
오미크론은 어디에서 퍼졌고, 과학자들은 그것을 어떻게 추적합니까?
더 많은 국가에서 오미크론 변종을 감지하고 있지만 긍정적인 코비드19(COVID-19 ) 테스트에서 바이러스를 신속하게 시퀀싱하는 능력은 부유한 국가에 집중되어 있어 오미크론의 확산에 대한 초기 데이터가 왜곡될 수 있습니다.
브라질 미나스제라이스 연방대학의 바이러스학자 레나토 산타나(Renato Santana)는 “브라질과 일부 다른 국가의 감시 노력은 특정 * PCR 테스트의 독특한 결과를 이용하여 시퀀싱을 위한 잠재적인 오미크론 사례를 정확히 찾아낼 수 있도록 하고 있다”고 말했다. 이 테스트는 3개의 바이러스 유전자 세그먼트를 찾습니다. 그 중 하나는 스파이크 단백질을 인코딩하는 유전자입니다. 오미크론의 스파이크 유전자에 있는 돌연변이는 테스트에서 검출을 방해합니다. 즉, 변이를 포함하는 샘플은 유전자 중 2개에 대해서만 양성으로 테스트됩니다.
그럼에도 불구하고 모든 사람이 해당 테스트를 사용하는 것은 아니며 오미크론의 확산이 완전히 지도화(매핑) 되기까지 시간이 걸릴 수 있습니다. 브라질 상파울루에 있는 건강연구소의 모든 것(All for Health Institute)의 컴퓨터 바이러스학자 앤더슨 브리토(Anderson Brito)는 국가에 사스 코비드 2( SARS-CoV-2)에 대해 양성 반응을 나타내는 샘플의 5%를 시퀀싱하도록 촉구하는 일부 지침에도 불구하고 그렇게 할 여유가 없다고 말합니다. 그리고 브리토(Brito)는 오미크론 발견 이후 일부 국가에서 남아프리카공화국과 다른 남아프리카 국가에 대해 제정한 여행 금지령이 정부가 게놈 감시 데이터를 공유하는 것을 방해할 수 있다고 우려합니다. "우리는 좋은 일을 한 사람들을 처벌합니다."라고 그는 말합니다.
사하(Saha)는 양성 코로나바이러스 샘플의 약 0.2%를 시퀀싱하는 방글라데시에서 연구원들은 오미크론 및 기타 새로운 변이체에 대한 탭을 유지하기 위해 시퀀싱을 강화하기를 열망할 것이라고 말했습니다. 그러나 자원은 제한되어 있습니다. 그녀는 방글라데시가 대규모 뎅기열 발병에서 회복하고 있다고 덧붙였습니다. 사하는 “남반구에서 우리는 모두 코로나바이러스에 대해 걱정하고 있지만 우리의 풍토병을 잊지 말자”고 말합니다. "우리가 할 수 있는 일은 제한되어 있습니다. “
도이: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03614-z
참고문헌(References)
- Pulliam, R. C. J. et al. Preprint at MedRxiv https://doi.org/10.1101/2021.11.11.21266068 (2021).
- Schmidt, F. et al. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 (2021).
